Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms