Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms