Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms