Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms