Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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