Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms