Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JSRP1Q96MG2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms