Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms