Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms