Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC41A2Q96JW4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC41A2Q96JW4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms