Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms