Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NKD1Q969G9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms