Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms