Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms