Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms