Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms