Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms