Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms