Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms