Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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CLDN19Q8N6F1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CLDN19Q8N6F1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CLDN19Q8N6F1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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