Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LTBP4Q8N2S1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms