Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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