Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms