Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms