Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms