Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX20Q7Z614 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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