Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms