Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPGS1Q6ZTW0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms