Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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