Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms