Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms