Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms