Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms