Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms