Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE12Q6L8Q7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE12Q6L8Q7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms