Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms