Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZKSCAN2Q63HK3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZKSCAN2Q63HK3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms