Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms