Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLX4IPQ5VYV7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLX4IPQ5VYV7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms