Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms