Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms