Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms