Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms