Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms