Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms