Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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FOXD1Q16676 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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FOXD1Q16676 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
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