Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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