Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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