Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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