Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
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